Comparison of fish assemblages recorded by visual census and video census / Comparación de ensamblajes de peces registrados por censo visual y censo por video

Abstract Introduction: Underwater visual censuses are the basis of many studies on fish ecology, however, a series of limitations and errors influence the traditional visual estimation of fish richness and abundance. Video techniques have been proposed to mitigate such errors, but there are few studies that compare the effectiveness of both methods. Objective: To compare the estimates obtained through the traditional census and the video census of the fish community of two localities in the central Mexican Pacific. Methods: We studied the fish community of two bays of Huatulco, Oaxaca, Mexico. We established sampling points in each bay and applied a traditional census and a diver-operated video census. We used comparison tests and analysis of similarity tests to compare richness, abundance and diversity by locality; and permutation tests for the same parameters at each sampling point. Results: Both censuses provide similar estimates regarding the richness, abundance, and diversity by locality and by sampling points. There were no statistically significant differences between traditional census and a diver-operated video census in terms of richness, abundance, and diversity. Conclusions: Video census using the diver-operated video technique can be used as a complement or as an alternative to traditional census. Its use can provide a more complete assessment, increase data acquisition, and implement long-term monitoring programs in areas where there are economic limitations for its operation.

Resumen Introducción: Los censos visuales submarinos son la base de muchos estudios sobre ecología de peces, sin embargo, una serie de limitaciones y errores influyen en la estimación visual tradicional de la riqueza y abundancia de peces. Se han propuesto las técnicas de video para mitigar tales errores, pero existen pocos estudios que comparen la efectividad de ambos métodos. Objetivo: Comparar las estimaciones obtenidas mediante el censo tradicional y el video censo de la comunidad de peces de dos localidades del Pacífico central mexicano. Métodos: Se estudió la comunidad de peces de dos bahías de Huatulco, Oaxaca, México. Se establecieron puntos de muestreo en cada bahía y se aplicó el censo tradicional y video censo operado por buzo. Se emplearon pruebas de comparación y análisis de pruebas de similitud para comparar riqueza, abundancia y diversidad por localidad; y pruebas de permutación para los mismos parámetros en cada punto de muestreo. Resultados: Ambos censos proporcionan estimaciones similares en cuanto a la riqueza, abundancia y diversidad por localidad y por punto de muestreo. No existieron diferencias estadísticamente significativas entre el censo tradicional y video censo operado por buzo respecto a riqueza, abundancia y diversidad. Conclusiones: El video censo mediante la técnica de video operado por buzo puede utilizarse como complemento o como alternativa al censo tradicional. Su uso puede proporcionar una evaluación más completa, aumentar la adquisición de datos e implementar programas de monitoreo a largo plazo en áreas donde existen limitaciones económicas para su operación.

Ant diversity sampling in the Brazilian Amazon: a comparison of litter collection and pitfall trapping / Muestreo de la diversidad de hormigas en la Amazonía brasileña: una comparación de recolección de hojarasca y trampas de caída

Abstract Introduction: Ants in tropical forests are a hyper-diverse group that plays important ecological roles. Several studies on tropical forests have used different sampling protocols to capture soil ants, making it difficult to compare responses and patterns of diversity between studies. Thus, research that compares different well-structured and standardized sampling methodologies to adequately estimate the richness of ant species in tropical forests is necessary. Objective: In this study, we examined the combination of catches with pitfall traps with and without baits and litter collections for soil ant sampling. Methods: In the fall traps, we use two baited (sardines and bananas) and one non-baited. For the manual collections (litter sampling), the litter and only the topsoil of the loose soil were collected. Results: We found that traps containing sardine baits collected a greater abundance of ants, whereas non-baited traps collected a greater richness of ant species. On the other hand, litter collections captured the largest number of exclusive species, presenting a different species composition from the pitfall traps (with and without baits). In general, baited traps showed greater abundance in more degraded locations, while manual collections and unbaited pitfalls captured more individuals in preserved environments. Conclusions: Our results provide evidence that, for accurate sampling of soil ant assemblages in tropical forests, the use of different methodologies is necessary to capture a greater diversity of species because the methods differ in effectiveness according to habitat.

Resumen Introducción: Las hormigas en los bosques tropicales son un grupo hiperdiverso que juega un papel ecológico importante. Varios estudios en los bosques tropicales han utilizado diferentes protocolos de muestreo para capturar las hormigas de suelo, lo que dificulta la comparación de respuestas y patrones de diversidad entre estudios. Por lo tanto, es necesaria una investigación que compare diferentes metodologías de muestreo bien estructuradas y estandarizadas para estimar adecuadamente la riqueza y uniformidad de las especies de hormigas en los bosques tropicales. Objetivo: En este estudio, examinamos la combinación de capturas con trampas de caída con y sin cebos y recolecciones manuales para muestreo de hormigas en el suelo. Métodos: En las trampas de otoño, utilizamos dos cebos (sardinas y plátanos) y uno sin cebo. Para las recolecciones manuales (muestreo de hojarasca), se recogió la hojarasca y solo la capa superior de suelo suelto. Resultados: Encontramos que las trampas que contenían cebos de sardina recolectaron una mayor abundancia de hormigas, mientras que las trampas sin cebo recolectaron una mayor riqueza de especies de hormigas. Por otro lado, las recolecciones de hojarasca capturaron el mayor número de especies exclusivas, presentando una composición de especies diferente a las trampas de caída (con y sin cebo). En general, las trampas con cebo mostraron mayor abundancia en lugares más degradados, mientras que las recolecciones manuales y las trampas sin cebo capturaron más individuos en ambientes preservados. Conclusiones: Nuestros resultados proporcionan evidencia de que, para un muestreo preciso de ensambles de las hormigas de suelo en los bosques tropicales, el uso de diferentes metodologías es necesario para capturar una mayor diversidad de especies, ya que los métodos difieren en la efectividad de acuerdo con el hábitat.

BYCATCH OF Helicops angulatus (LINNAEUS 1758) (REPTILIA: SQUAMATA: COLUBRIDAE) IN HOOP-TRAPS USED TO CAPTURE FRESH WATER TURTLES ON THE COAST OF PARÁ, BRAZIL / Captura accidental de Helicops angulatus (Linnaeus 1758) (Reptilia: Squamata: Colubridae) en trampas en embudo usadas para capturar tortugas dulceacuícolas en la costa de Pará, Brasil

Between September, 2007, and August, 2009, six field excursions were conducted on the northern Brazilian coast (Romana and Maiandeua islands, state of Pará) for the collection of specimens of freshwater turtles (Rhinoclemmys punctularia and Kinosternon scorpioides) in natural ponds. Hoop trap were used and 35 specimens of brown-banded water snakes, Helicops angulatus, were captured as bycatch in the traps. Thus, in addition to turtles, the procedure may be useful to sample populations of aquatic snakes.

Entre septiembre de 2007 y agosto de 2009, seis excursiones de campo se llevaron a cabo en la costa norte de Brasil (islas Romana y Maiandeua, estado de Pará) para la recolección de especímenes de tortugas de agua dulce (Rhinoclemmys punctularia y Kinosternon scorpioides) en posos naturales. Utilizamos trampas en embudo. 35 ejemplares de la serpiente acuática Helicops angulatus, fueron capturados como pesca incidental en las trampas. Por lo tanto, además de las tortugas, el procedimiento puede ser útil para la toma de muestras de las poblaciones de serpientes acuáticas.

A comparison of visual and collection-based methods for assessing community structure of coral reef fishes in the Tropical Eastern Pacific / Una comparación de métodos visuales y basados ​​en colecciones para evaluar la estructura de la comunidad de peces de arrecifes de coral en el Pacífico Oriental Tropical

Gorgona Island, the major insular area in the Colombian Pacific Ocean, is characterized by a remarkably high biological and ecosystem diversity for this area of the world. Coral reefs are well developed and their fish communities have been described using conventional visual surveys. These methods, however, are known to be biased towards detecting larger and more mobile species, tending to ignore small and cryptobenthic species. The two main objectives of this study were to describe the assemblage structure of the cryptobenthic fish fauna and estimate the extent to which this fauna is underestimated by visual surveys.At the beginning and the end of the warm season, we compared the cryptobenthic fish assemblage recorded using visual surveys against the one recorded using “enclosed anesthetic/rotenone samples” on isolated coral colonies (N=54 beginning of warm season; N=17 end of warm season). The crypthobenthic fish fauna associated to coral colonies was characterized by small body sizes and was composed mainly by species of the families Antennaridae, Blennidae, Gobiidae, Labrisomidae, Muraenidae, Serranidae, Scorpaenidae and Syngnathidae. Conventional visual surveys underestimated overall species richness by 28-36% and number of individuals by 16-35%. Noteworthy, four species recorded during this study using “enclosed anesthetic/rotenone samples” were new records for Gorgona Island. Although both sampling methods can detect a largely overlapping group of species, the “enclosed anesthetic/rotenone samples” method was able to detect more individuals and species, including several species that visual surveys fail to detect. Although this study is the first effort to describe the cryptobenthic fish assemblage associated to coral reefs in the Tropical Eastern Pacific, our results suggest that these assemblages are an important component of the reef fish community in the region in terms of biodiversity and functional roles. Rev. Biol. Trop. 62 (Suppl. 1): 359-371. Epub 2014 February 01.

Métodos de muestreo convencionales (censos visuales) usados en el estudio de peces arrecifales han llevado a una constante subestimación de la riqueza de especies, ya que estos tienden a ignorar especies pequeñas y crípticas. En este estudio describimos la estructura del ensamblaje de peces criptobentónicos en Isla Gorgona, Colombia y estimamos el grado en que este ensamblaje es subestimado al usar censos visuales. Al comienzo y al final de la estación cálida comparamos la capacidad de detección de censos visuales vs “muestreos cerrados con anestésico/rotenona” (N=54 comienzo; N=17 final). La fauna criptobentónica se caracterizó por mantener individuos de tamaños corporales pequeños, pertenecientes principalmente a las familias Antennaridae, Blennidae, Gobiidae, Labrisomidae, Muraenidae, Serranidae, Scorpaenidae and Syngnathidae. Los censos visuales subestimaron la riqueza de especies en un 28-36% y el número de individuos en un 16-35%. Aunque un gran número de especies son detectadas usando ambos métodos, los “muestreos cerrados con anestésico/rotenona” detectan un mayor rango de especies. Este estudio, el primer esfuerzo para describir el ensamblaje de peces criptobentónicos asociados a arrecifes coralinos en Colombia, sugiere que la fauna criptobentónica puede ser un componente importante de la comunidad arrecifal en términos de biodiversidad y papel funcional.

Nuevas formas de muestreo para minorías y poblaciones ocultas: muestras por encuestado conducido en una población de inmigrantes sudamericanos / New forms of sampling for minority and hidden populations: respondent samples conducted in a south american immigrant population

El Respondent-Driven Sampling (RDS) es un método de muestreo para poblaciones ocultas o de difícil acceso. Se trata de un procedimiento que permite realizar estimaciones de la representatividad de la muestra en aquellos grupos en que desconocemos el marco muestral. En este estudio, se presenta tanto la descripción teórica de dicha forma de muestreo como el reporte de su aplicación práctica en el caso de minorías étnicas (inmigrantes bolivianos, peruanos y colombianos) en el norte de Chile. El estudio comenzó con ocho semillas y se reclutó una muestra total de 109 personas provenientes de Colombia, Perú y Bolivia. La información resultante del procedimiento RDS informa de un patrón similar de reclutamiento entre hombres y mujeres, reflejando que los tamaños de las redes de ambos grupos no difieren significativamente.

The Respondent-Driven Sampling (RDS) is a method of sampling for hidden or hard-to-reach populations. This is a procedure for estimating the representativeness of the sample in those groups that is unknow the sampling frame. This study presents both the theoretical description of this form of sampling as the report of its practical application in the case of ethnic minorities (immigrants Bolivians, Peruvians and Colombians) in northern Chile. The study started with 8 seeds and recruited a total sample of 109 people from Colombia, Peru and Bolivia. The information resulting from the procedure RDS reports a similar pattern of recruitment for men and women, reflecting the sizes of the networks of both groups did not differ significantly.

Comparación de métodos de muestreo en la caracterización de la biodiversidad de hifomicetos acuáticos en el río cúpira, estado Carabobo, Venezuela / Comparison of sampling methods for the characterization of aquatic hyphomycetes biodiversity in the cupira river, Carabobo, Venezuela / Comparação dos sistemas da coleção da amostra para caracterização da biodiversidade de hyphomycetes aquáticos no rio de cúpira (la Cumaca, edo. Carabobo)

Diferentes métodos de colección de muestras fueron evaluados para caracterizar mensualmente la biodiversidad de hifomicetos acuáticos en el Río Cúpira sector La Cumaca (Municipio San Diego, Estado Carabobo, Venezuela). La identificación de las especies de hongos acuáticos se realizó por examen de muestras de espuma natural (blanca o amarilla), de espuma artificial e incubación de hojas tomadas al azar. Se encontró que la diversidad de hifomicetos acuáticos variaba con el método de colección de muestra, evidenciándose el mayor número de especies al utilizar espuma natural. Con la espuma blanca fueron reportadas 41 especies, 30 con la amarilla, 19 en espuma artificial y 12 especies con el método de incubación de hojas. Las especies más abundantes y comunes en todos los sistemas de colección de muestra fueron: Alatospora acuminata, Anguillospora longissima, Campylospora sp., Clavatospora tentacula, Flagellospora curvula, Heliscus submersus, Lunulospora cymbiformis, y Triscelophorus monosporus.

Different sampling methods were evaluated for a monthly characterization of aquatic hyphomycetes biodiversity in the Cupira river (La Cumaca sector, San Diego municipality, Carabobo state, Venezuela). Species were identified in natural foam samples (white or yellow), artificial foam and by incubation of randomly collected leaves. Diversity varied with the sampling method, the greater number of species being found in natural foam, with 41 species reported from white natural foam and 30 from yellow natural foam. In artificial foam, 19 species were reported, and in incubated leaves, 12 species. The most abundant and common species in all the sampling methods were: Alatospora acuminata, Anguillospora longissima, Campylospora sp., Clavatospora tentacula, Flagellospora curvula, Heliscus submersus, Lunulospora cymbiformis and Triscelophorus monosporus.

Diferentes métodos da coleção da amostra foram avaliados para caracterização mensal da biodiversidade dos hyphomycetes aquáticos da "La Cumaca" no Río Cúpira (Municipalidade de San Diego, estado de Carabobo). A identificação da espécie destes fungos foi realizada das amostras da espuma naturai (branca ou amarela), da espuma artificial e da incubação aleatòria das folhas coletadas. A diversidade dos hyphomycetes aquáticos variou com o método de coleção da amostra; o maior número de espécies foi com espuma natural, com 41 espécies com espuma branca e 30 com espuma amarela. No segundo lugar foi para a espuma artificial com 19 espécies, seguido pela incubação aleatòria das folhas coletadas com 12 espécies. As espécies mais abundantes e mais comuns em todos os métodos de coleção da amostra foram: Alatospora acuminata, Anguillospora longissima, Campylospora sp., Clavatospora tentacula, Flagellospora curvula, Heliscus submersus, Lunulospora cymbiformis e Triscelophorus monosporus.

Un estudio comparativo de tres métodos de muestreo para poblaciones ocultas ode difícil acceso / A comparison of three methods for sampling hard - to - reach or hidden populations

Los proyectos de investigación que necesitan reclutar participantes pertenecientesa poblaciones “ocultas” o “difíciles de encontrar” requieren de métodos de muestreoque no solo faciliten la recolección de los datos y la confidencialidad, sino tambiénque incrementen la validez externa y permitan hacer inferencias estadísticasapropiadas. Este artículo presenta tres métodos que han demostrado ser útiles enlos trabajos de investigación con estas poblaciones estigmatizadas, clandestinaso de difícil acceso: 1) Muestreo basado en sitios y horarios específicos (VenueBased Time- Location Sampling). 2) Muestreo de áreas en las que se localiza lapoblación blanco o población objeto de estudio (Targeted Sampling). 3) Muestreodirigido por el participante (Respondent Driven Sampling). Luego de analizar lascaracterísticas, ventajas y limitaciones de cada método de muestreo, se presentauna comparación de todos ellos en términos de validez externa, posibilidad deobtener muestras probabilísticas y empleo de investigación etnográfica.

Research projects that need to recruit “hard-to-reach” or “hidden populations”require sampling methods that not only facilitate data collection and confidentialitybut also increase external validity and allow for statistically appropriate inferences.This paper presents three sampling methods useful for researchers who workwith stigmatized hard-to-reach or clandestine populations: 1) Venue Based Time/Location Sampling, 2) Targeted Sampling; and 3) Respondent Driven Sampling.The characteristics, advantages and limitations for each method are analyzed.They are also compared in terms of the possibility of obtaining probabilisticsamples, external validity, and use of ethnographic research.

Projetos de pesquisa que necessitam recrutar participantes pertencentesa povoações “oculta” ou “difíceis de encontrar” requerem de métodos deamostragem que não só facilitem a colheita dos dados e a confidencialidade mastambém que aumentem a validade externa e permitam fazer inferências estatísticasapropriadas. Este artigo teórico apresenta três métodos que demonstraram serúteis nos trabalhos de pesquisa com estas povoações estigmatizadas, clandestinasou de difícil acesso: 1) Amostragem baseado em lugares e horários específicos(Venue Based Time- Location Sampling); 2) Amostragem de áreas nas quais selocaliza a população branco ou população objeto de estudo (Targeted Sampling);e 3) Amostragem dirigido pelo participante (Respondent Driven Sampling).Depois de analisar as características, vantagens e limitações de cada método deamostragem, se apresenta uma comparação de todos eles em termos de validadeexterna, possibilidade de obter amostras probabilísticas e emprego de pesquisaetnográfica.